O Sistema de Controle Interno (SCI) da Universidade Estadual de Campinas (Unicamp) é composto por representantes dos seguintes órgãos:
- Pró-Reitoria de Desenvolvimento Universitário (PRDU)
- Diretoria Acadêmica (DAC)
- Diretoria Executiva de Planejamento Integrado (DEPI)
- Diretoria Executiva de Administração (DEA)
- Diretoria Executiva da Área da Saúde (DEAS)
- Assessoria de Economia e Planejamento (Aeplan)
- Controladoria Geral
- Diretoria Geral da Administração (DGA)
- Diretoria Geral de Recursos Humanos (DGRH)
- Ouvidoria
- Procuradoria Geral (PG)
A presidência do SCI é exercida pelo Coordenador Geral da Universidade, com o Pró-Reitor de Desenvolvimento Universitário assumindo em casos de impedimento. A Controladoria Geral desempenha a função de secretaria do SCI.